法兰克掷斧兵的首要弱点在于其相对较短的攻击射程与对远程火力的脆弱性。作为一远程攻击步兵，其基础射程仅为3，即便在研究了城堡特色科技芒刺斧后，射程也仅增加1，这使得它在与专业的弓箭手、弩炮或骑射手对射时处于绝对劣势。较低的射程使其极易被对方的远程单位利用射程优势进行打了就跑的战术消耗，同时其自身护甲尤其是对箭矢的防御能力较弱，在面对密集的远程火力时战损会很高。在实战中必须避免让掷斧兵暴露在敌方的箭雨或弩炮轰击之下，需要其他单位为其创造安全的输出环境。
该兵种的另一主要弱点是惧怕高机动性的近战骑兵，尤其是某些具有特殊加成的骑兵单位。尽管掷斧兵作为步兵对长枪兵等反骑兵单位有优势，但其缓慢的移动速度使其在面对快速突进的骑士或骆驼骑兵时难以逃脱。一旦被这类高攻击力的近战骑兵近身，掷斧兵将因为血量不高且近战能力平庸而迅速溃败。像萨拉森的奴隶兵这样的特色骑兵单位，对掷斧兵也能构成极大威胁。这意味着在使用掷斧兵时，必须时刻注意保护其侧翼，通常需要搭配己方的骑士部队来驱赶或拦截对方的突击骑兵。
掷斧兵自身的属性也限制了其作为主战兵种的泛用性。其移动速度偏慢，不如许多其他步兵单位灵活，这在调整阵型或进行战术机动时是一个明显短板。虽然它拥有远程攻击能力，但攻击间隔和弹道速度并不突出，在对抗海量低级单位时清理效率可能不如某些范围伤害单位。掷斧兵作为法兰克的特色单位，其强大之处在于与法兰克强势的骑士部队形成互补，而非独立作战。脱离体系保护的纯掷斧兵部队，很容易被对手针对其上述弱点进行破解。
从资源与升级角度来看，精锐掷斧兵的升级成本较高，需要在帝王时代投入大量食物与黄金。这在与法兰克本身强势的游侠升级路线竞争资源时，有时会显得性价比不足。是否将宝贵的帝王时代资源用于升级精锐掷斧兵，而非提升骑士部队的攻防或冲击游侠，是一个需要根据战局仔细权衡的决策。在资源紧张的后期，过度投资于掷斧兵可能会影响法兰克核心骑兵战力的最终成型。
