武器的选择直接影响战斗效率和通关体验。综合强度、适用性和获取难度，天堂之拳、群星之弓和寒光月华剑被称为元气三幻神，这三者并列第一梯队。天堂之拳具备高伤害、弹射效果和攻速优势，适合零配或高配场景；群星之弓对群能力出色且蓝耗低，但合成门槛较高；寒光月华剑则兼顾伤害与控制，造价低廉但需注意真空期。
远程武器中，魔法弓和火龙步枪是性价比极高的选择。魔法弓蓄力后可发射5支追踪箭，搭配狂战士技能可瞬秒BOSS；火龙步枪拥有双形态，基础形态不耗蓝且伤害稳定，激光形态适合爆发输出。近战武器推荐雷剑和晶蟹太刀，前者范围大且附带雷电效果，后者能触发地刺攻击，清怪效率优异。元素类武器如红龙步枪和冰霜之鹰也值得考虑，前者附加灼烧伤害，后者提供冻结控制。
对于新手玩家，低消耗或零消耗武器更易上手。光剑系列和火焰斧无需蓝耗，适合前期过渡；弹射轨道炮和樱花散弹枪虽然输出平缓，但操作简单且清怪稳定。若追求高爆发，电弧手里剑和闪电法杖是不错的选择，前者对单伤害突出，后者弹幕密集且适合贴脸输出。部分武器如死灵法杖和玄冥因高耗蓝或效果不稳定，需谨慎使用。
改良冲锋枪搭配攻速配件可卡出极限射速，成为通关神器；导弹发射器配合高效反应堆能实现零耗蓝连发。近战武器优先选择磨刀鱼增加伤害，远程武器则适配子弹鱼或珊瑚挂件提升穿透与暴击。团队作战时，天气控制器和能量装置等辅助配件可优化输出环境。
