研究协议是用于定向获取舰船蓝图的系统，通过缩小卡池范围提升目标舰船的获取概率。玩家每日可签署5次协议，需选择合作企业、战略性能和战术性能三个方向。委托公司包括木星工业、诺玛运输等，战略性能分为火力出众、持续作战等类别，战术性能则区分直射与投射武器。协议分为三个阶段，完成全部阶段后绘制蓝图可最大化收益，通常需25天积累技术储备开启一次完整研究。
战机和护航艇路线适合需要空中支援的玩家，孢子战斗机是热门选项。火力出众路线包含多种主力舰船，如新君士坦丁大帝级、维塔斯B、星云脉冲等，适合舰队核心构建。直射武器路线偏向高爆发舰船，投射武器路线则以卡利斯托重型巡洋舰为代表。部分路线存在高价值舰船与普通舰船的混合卡池，需权衡风险与收益。
限时研究协议随星系态势解锁，提供短期高价值蓝图获取机会。定向技术转换功能允许将非目标蓝图的研究进度转化为指定蓝图，累计达到100%即可解锁。该功能降低了重复获取无效蓝图的风险，但需消耗比邻星币。研究进度达到20%可试验建造，100%解除服役限制。限时协议分为企业展销、战略补充等类型，需根据舰队需求选择。
