疯狂动物园的核心吸引力在于超过100种基础动物和数十种隐藏动物的收集系统。游戏中的动物分为常规动物和隐藏动物两大类别，常规动物通过基础探索即可捕获，而隐藏动物需达成特定条件才会出现。动物种类覆盖草原、丛林、山脉、澳洲、极地等不同生态环境，包括暗黑野牛、特洛伊斑马、油炸狮等独特品种，部分隐藏动物如机械秃鹰需在跑酷1400米后的大石头上触发。从生态分类看，陆地、飞行、水生动物均有涉及，其中草原地图基础动物数量最多，山脉地图则包含较多高难度隐藏物种。
隐藏动物的捕获机制是游戏深度玩法的重要组成部分。每只隐藏动物都有严格的触发逻辑，例如骑乘同一只野牛持续奔跑700米可解锁暗黑野牛，连续换乘7种不同草原动物能引出特洛伊斑马。丛林地图的鸭嘴河马要求骑乘同一只河马跑1600米，而山脉地图的苏-24战斗熊需要骑老鹰飞行2000米。这类设计不仅考验操作技巧，更要求玩家熟悉动物行为规律与地图特性。部分隐藏动物如机械秃鹰还需结合环境要素，需在长颈鹿或大象狂暴状态下才能发现。
动物驯服后的养成体系直接影响游戏经济收益。将捕获的动物安置在飞船动物园后，其稀有度与种类会显著影响游客流量与金币产出。隐藏动物普遍具有更高的展示价值，如三头凤凰、仙女企鹅等特殊品种能提升园区评级。玩家需合理规划栖息地升级顺序，优先扩展高收益动物栏位。不同动物组合可能激活特殊效果，例如同时饲养特定种类的极地动物与外来动物，会提升整体幸福度系数。
动物捕获的成功率受骑乘技巧直接影响。基础动物通常通过常规套索即可捕获，而隐藏动物往往需要在狂暴状态下维持平衡。例如驯服油炸狮时，需用同一只狮子连续捕食30个动物且不能中断。山脉地图的蒸汽朋克则要求骑乘耗牛连续撞击10只动物，这对走位精度与节奏把控提出更高要求。建议在挑战高难度动物前，先通过常规动物熟悉各物种的狂暴特征与应对方式。
